故事发生在一所名叫第3新东京世立NERV学园中，校长是严肃又寡言的碇原度（立木文彦 配音）。作为校长的儿子，碇真嗣（绪方惠美 配音）感到压力很大。于此同时，来自外国的红发转学生明日香（宫村优子 配音），分裂成三个、以姐妹的形式出场的凌波丽（林原惠美 配音）都给碇真嗣的学校生活带来了翻天覆地的变化。此外，在原作中高大帅气的初号机，也将以娇小可爱的形象，作为学院的一份子出现在动画中。 动画以《新世界福音战士》中的角色为原型，一改原作沉重严肃的气氛，描述了轻松愉快的校园生活。制作方首次采用了3D的Q版造型，配以实景背景和2D拼接，造就了多元化的绘画风格。
演员：矢岛晶子 小林由美子 楢桥美纪 藤原启治 森川智之 兴梠里美 真柴摩利 林玉绪 一龙斋贞友 佐藤智惠 高田由美 七绪春日 富泽美智惠 三石琴乃 纳谷六朗 森田顺平
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演员：潘惠美 伊濑茉莉也 泽城美雪 藤原启治 浪川大辅 宫野真守 内田直哉 山口胜平 日高法子 荒川美穗 朴璐美 大塚明夫 大桥贤一郎 前田玲奈 木内秀信 山寺宏一 松风雅也 能登麻美子 堀内贤雄 岩男润子 永井一郎 银河万丈 平野绫 岸尾大辅 关俊彦 寺崎裕香 植田佳奈 横山智佐 池田秀一 内山昂辉 藤村步 立木文彦 羽多野涉 楠大典 三木真一郎 高木涉 井上喜久子 飞田展男 远藤绫 内田真礼 高桥广树 大谷育江 二又一成
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